El órgano de la iglesia de San Juan de la Palma se encuentra situado en el coro alto, sobre el lateral trasero del muro de la nave central y bajo un arco. Si entras por la puerta principal de la iglesia y miras hacia arriba a la izquierda lo podrás ver de inmediato.
Es un órgano de estilo neoclásico con pilastras y capiteles corintios. El mueble se fabricó en madera policromada con rombos negros con los bordes dorados. En la parte central destaca su remate, un ángel tocando el arpa.
Tiene un sólo teclado con 51 puntos manuales y es de transmisión mecánica. Cada tecla está decorada con un damasquinado. Las etiquetas de los registros no son las originales y se aprecian algunos dientes, escudos, entallas e inscripciones en los tubos.
El órgano se encuentra en regular estado de conservación. La última vez que se restauró fue en 1965 y el restaurador dejó la siguiente nota:
“Restaurado el 24 junio 1965.
Manuel Vallejo Ortiz.
Campanas y órganos.
La Laboriasa, 16 pal. Dcha. Sevilla”.